Ministarstvo koje je vodio Pejović postoji svega godinu i pet mjeseci, a osnovano je 28. novembra 2016. godine.

Odluka o ukidanju uslijedila je pošto je Pejović prošlog mjeseca podnio ostavku, a nakon što je Agencija za sprečavanje korupcije utvrdila da je u konfliktu interesa. Odmah za njim resor evropskih poslova napustila je i državna sekretarka Marina Vujačić.

Potpredsjednik Vlade i ministar pravde Zoran Pažin trenutno rukovodi Ministarstvom evropskih poslova, a obaveze prema Evropskoj uniji preuzeće Ministarstvo vanjskih poslova na čijem je čelu Srđan Darmanović.

U izvještaju o radu Ministarstva evropskih poslova u 2017. godini navodi se da su, od ukupno 28 obaveza planiranih Programom rada ministarstva, 23 realizovane, što čini 82,2 odsto realizacije, dok je pet nerealizovanih.